Veiledning for uttak av vev for DNA analyse v. 1.3

Nødvendig utstyr:

• Sterile disseksjonssakser / Biopsitang

• Sterile pinsetter

• 2D-kodet 1 ml prøverør (med lokk) med konserveringsbuffer (bestilles fra www.blueanalytics.no/)

• Etanol eller 70% isopropylalkohol for overflatedesinfeksjon

• PC

• Bærbar PIT-tag-skanner tilkoblet PC (hvis fisken har PIT-tag)

• Bærbar 2D/QR-kodeskanner tilkoblet PC

• Sterile hansker

• Ren, flat overflate for disseksjon

 

Prosedyre:

1.      Forbered arbeidsområdet:

• Rengjør disseksjonsområdet grundig med egnet desinfeksjonsmiddel for å minimere risiko for kontaminering.

• Klargjør PIT-tag-skanneren og forsikre deg om at den fungerer korrekt.

• Sett opp QR-kodeskanneren og forsikre deg om at den fungerer korrekt.

2.      Bedøving av fisken:

• Bruk egnet bedøvelse for å bedøve fisken og redusere stress under prosedyren. Følg anbefalt dosering og retningslinjer for den spesifikke arten.

3.      Skanning av PIT-tag:

• Mens fisken er bedøvet, bruk PIT-tag-skanneren til å lese det unike identifikasjonsnummer fra PIT-taggen implantert i fisken. Registrer dette nummeret i et regneark. Dette nummeret vil bli brukt for å knytte fiskens ID til rør-ID. Hvis ikke PIT-tag benyttes, registrer annen relevant individuell eller familiebasert informasjon i dette feltet.

4.      Skann prøverøret:

• Umiddelbart etter å ha skannet PIT-taggen, ta et ubrukt prøverør og skann QR-koden på bunnen av røret direkte inn i det samme regnearket for å sikre at QR-koden er koblet til det unike identifikasjonsnummeret fra skannet PIT-tag.

5.      Ta en biopsi:

• Legg forsiktig den bedøvede fisken på den rene overflaten med halefinnen tilgjengelig for prøvetaking. Hvis halefinnen ikke egner seg for prøvetaking, vurder en brystfinne.

• Med biopsitangen eller saksen, skjær forsiktig ut en liten 3 mm biopsi fra halefinnen. Pass på å ikke skade andre vev eller forårsake unødvendig skade på fisken.

6.      Plassering av biopsien i prøverøret:

• Åpne prøverøret med konserveringsbuffer forsiktig, slik at innsiden av lokket og røret forblir ukontaminert.

• Plasser biopsien i prøverøret ved hjelp av en steril pinsett. Sørg for at biopsien er helt nedsenket i buffervæsken for å sikre riktig bevaring av DNA.

• Lukk prøverøret tett med lokket for å forhindre lekkasje eller kontaminering.

7.      Etter prøvetaking av fisken:

• Behandle fisken skånsomt etter prøvetaking for å hjelpe den med å komme seg etter prosedyren og bedøvelsesvirkningene

8.      Lagrings- og forsendelseskrav:

• Vevsprøver må oppbevares kjølig fra innsamling til forsendelse. Prøver må sendes innen utløpsdatoen for bufferen som er merket på boksen til prøverørene. Det anbefales å sende så snart all prøvetaking er fullført.

• Prøvene må pakkes i en isoporeske og sendes på is / med kjøleelementer.

• Prøvene må sendes som en ekspress overnatt pakke. Sporingsnummeret for forsendelsen skal sendes til: mottak@blueanalytics.no

• Det fullførte bestillingsskjemaet Bestillingsskjema Genomikk må alltid inkluderes i pakken slik at Blue Analytics vet hva prøvene er.

• Regnearket som knytter fiskens ID (PIT-tag-nummer) og rør-ID (QR-kode) skal sendes til: mottak@blueanalytics.no ved prøveforsendelse, sammen med en elektronisk kopi av det fullførte bestillingsskjemaet Bestillingsskjema Genomikk.

 

Leveringsadresse:

Blue Analytics AS

Kong Christian Frederiks plass 3, inngang A, 1. etasje

5006 Bergen

 

Merk: Følg alltid de relevante etiske retningslinjene og skaff nødvendige tillatelser for fiskeprøvetaking og forskning. Bruken av PIT-tags og QR-koder er avgjørende for å opprettholde nøyaktige dataregistre og spore individuelle fiskeprøver gjennom DNA- og genotyping-prosessen og for nedstrøms dataanalyser.